ระบบ PGS ของนิวซีแลนด์เลือกที่จะใช้มาตรฐานกลางระดับประเทศของหน่วยตรวจรับรองเกษตรอินทรีย์ BioGro ซึ่งเป็นหน่วยตรวจรับรองเอกชน ซึ่งมาตรฐานนี้ได้รับการยอมรับว่าทัดเทียมกับเกณฑ์มาตรฐานเกษตรอินทรีย์ของสมาพันธ์เกษตรอินทรีย์นานาชาติ (IFOAM) และสหภาพยุโรป โดยทาง OrganicFarmNZ เชื่อว่า การใช้มาตรฐานกลางของหน่วยตรวจรับรองเอกชนที่เป็นที่ยอมรับทั้งจากผู้บริโภคในประเทศและต่างประเทศอยู่แล้ว จะทำให้การตรวจรับรอง PGS มีความน่าเชื่อถือมากขึ้น ส่วนโครงสร้างของระบบ PGS นิวซีแลนด์นั้นประกอบด้วยเครือข่ายย่อยในระดับท้องถิ่น/ภูมิภาค (ซึ่งเรียกชื่อว่า pod) ที่เป็นการรวมกลุ่มกันของเกษตรกรในพื้นที่ ซึ่งเกษตรกรจะต้องทำหน้าที่ในการตรวจสอบกันเองเป็นเบื้องต้นก่อน หลังจากนั้น เครือข่ายท้องถิ่นก็จะทำการรับรองเกษตรกรที่เป็นสมาชิกใน pod นอกจากนี้ คณะกรรมการระดับประเทศจะสุ่มตรวจเกษตรกรในแต่ละ pod ซ้ำอีกอย่างน้อยหนึ่งคนในแต่ละปี
เกษตรกรที่เลือกใช้ระบบ PGS ทั้งหมดเป็นเกษตรกรรายย่อย ที่มีผลผลิตจากฟาร์มไม่มาก และมีเป้าหมายในการจำหน่ายผลผลิตของตนในท้องถิ่นเป็นหลัก ซึ่งเกษตรกรจะต้องจ่ายค่าธรรมเนียมรายปีให้กับ OrganicFarmNZ เป็นเงิน 375 เหรียญนิวซีแลนด์ต่อปี (ประมาณ 9,653 บาท) เพื่อเป็นค่าใช้จ่ายในการดำเนินงานต่างๆ รวมทั้งค่าตรวจรับรองด้วย
เกษตรกรที่ได้รับการรับรองในระบบ PGS นี้ จะสามารถใช้ตรารับรอง OrganicFarmNZ
