จากการสรุปผลการทำงานในช่วง 5 ปีที่ผ่านมาของแผนปฏิบัติการพัฒนาเกษตรอินทรีย์ (ตามกรอบของแผนยุทธศาสตร์พัฒนาเกษตรอินทรีย์) มีผลความก้าวหน้าในหลายด้าน โดยเฉพาะ
- การเผยแพร่และประยุกต์ใช้งานวิจัยจำนวน 92 เรื่อง
- การจัดทำฐานข้อมูล 3 เรื่อง คือ นวัตกรรมธุรกิจเกษตรอินทรีย์ การตลาดสินค้าเกษตรอินทรีย์ และองค์ความรู้และนวัตกรรมเกษตรอินทรีย์
- ผลักดันให้มีการลงทุนในธุรกิจนวัตกรรมเกษตรอินทรีย์ 33 โครงการ
- เผยแพร่ความรู้ให้กับเจ้าหน้าที่รัฐและเกษตรกร 62,886 คน
- จัดงาน Organic and Natural Expo 2011
- จัดทำเครื่อข่ายความรู้ในระดับภูมิภาค 13 แห่ง
- ส่งเสริมและถ่ายทอดการใช้ปัจจัยการผลิตทดแทนการใช้สารเคมีให้เกษตรกร 70,000 กลุ่ม 3.85 ล้านราย
- ถ่ายทอดความรู้และสนับสนุนปัจจัยการผลิตให้เกษตรกร 34,800 กลุ่ม 1.8 ล้านราย
- รับรองเกษตรกร ผักและผลไม้ 2,046 ราย ข้าว 1,697 ราย ประมง 27 ราย ปศุสัตว์ 25 ราย
แต่ทั้งนี้ ไม่มีการสรุปว่า ได้มีการใช้เงินงบประมาณในการดำเนินการภายใต้ยุทธศาสตร์เกษตรอินทรีย์ในช่วง 5 ปีที่ผ่านมาเป็นจำนวนเท่าไหร่ นอกจากนี้ ทางกระทรวงเกษตรฯ ยังได้วิเคราะห์ว่า แนวทางการสงเสริมเกษตรอินทรีย์ในช่วงต่อไปยังคงควรจะให้ความสำคัญกับ 2 แนวทาง คือ เกษตรอินทรีย์สำหรับตลาดภายในประเทศและเกษตรอินทรีย์สำหรับการส่งออก
คณะกรรมการได้มีมติให้มีการจัดตั้งคณะอนุกรรมการ 19 คน เพื่อจัดทำแผนยุทธศาสตร์การพัฒนาเกษตรอินทรีย์ พ.ศ. 2556 – 2559 โดยกรอบแนวคิดเบื้องต้นของยุทธศาสตร์ดังกล่าวน่าจะเน้นการพัฒนา 8 ด้าน คือ บุคลากรด้านเกษตรอินทรีย์ ระบบฐานข้อมูล โครงสร้างพื้นฐาน (เช่น โรงงานปุ๋ยอินทรีย์ ฉางข้าว โรงสีชุมชน) มาตรฐานเกษตรอินทรีย์ไทยแบบ one stop service เครือข่ายวิสาหกิจระหว่างผู้ผลิตและผู้ประกอบการ กองทุนหมุนเวียนสนับสนุนเกษตรกรและผู้ประกอบการ ช่องทางจำหน่ายผลผลิต และกลไกกำกับดูแลเชื่อมโยงการทำงานระดับชาติ-จังหวัด-พื้นที่